Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trak1Q6PD31 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms