Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb40Q6PCS8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms