Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhb9Q6PB60 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms