Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atl2Q6PA06 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl2Q6PA06 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms