Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms