Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frg2f1Q6P3A2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms