Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Szrd1Q6NXN1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms