Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpsf6Q6NVF9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms