Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ltv1Q6NSQ7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms