Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pdcd11Q6NS46 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms