Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms