Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt42Q6IFX2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt42Q6IFX2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms