Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arhgap20Q6IFT4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arhgap20Q6IFT4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms