Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud6aQ6IE21 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms