Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms