Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep290Q6A078 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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