Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzrn3Q69ZS0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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