Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Msl2Q69ZF8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl2Q69ZF8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 294.6 ms