Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms