Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF6

Git1, ARF GTPase-activating protein GIT1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Git1Q68FF6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Git1Q68FF6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms