Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms