Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CltcQ68FD5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms