Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms