Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrp4eQ66X19 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4eQ66X19 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4eQ66X19 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms