Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef39Q66JY6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Arhgef39Q66JY6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Arhgef39Q66JY6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Arhgef39Q66JY6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Arhgef39Q66JY6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Arhgef39Q66JY6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Arhgef39Q66JY6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef39Q66JY6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms