Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tbr1Q64336 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tbr1Q64336 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tbr1Q64336 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tbr1Q64336 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tbr1Q64336 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tbr1Q64336 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Tbr1Q64336 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tbr1Q64336 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tbr1Q64336 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms