Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms