Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga3Q62470 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga3Q62470 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms