Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa13Q62424 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms