Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff3Q62395 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms