Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrhQ62361 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrhQ62361 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrhQ62361 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrhQ62361 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrhQ62361 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrhQ62361 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrhQ62361 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrhQ62361 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrhQ62361 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms