Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms