Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga7Q61738 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms