Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms