Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli3Q61602 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli3Q61602 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms