Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms