Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms