Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms