Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JrkQ60976 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JrkQ60976 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JrkQ60976 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms