Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vdac3Q60931 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vdac3Q60931 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms