Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DbpQ60925 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DbpQ60925 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms