Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atf3Q60765 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms