Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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PtprnQ60673 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms