Protein–RNA interactions for Protein: Q60604

Scin, Adseverin, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScinQ60604 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScinQ60604 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScinQ60604 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScinQ60604 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScinQ60604 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ScinQ60604 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ScinQ60604 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ScinQ60604 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ScinQ60604 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ScinQ60604 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScinQ60604 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScinQ60604 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ScinQ60604 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScinQ60604 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScinQ60604 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ScinQ60604 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScinQ60604 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ScinQ60604 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms