Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV6

Lmtk3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk3Q5XJV6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmtk3Q5XJV6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lmtk3Q5XJV6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms