Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Trim38Q5SZ99 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Trim38Q5SZ99 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Trim38Q5SZ99 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Trim38Q5SZ99 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Trim38Q5SZ99 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Trim38Q5SZ99 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Trim38Q5SZ99 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Trim38Q5SZ99 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim38Q5SZ99 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms