Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms