Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggnbp2Q5SV77 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms