Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tns3Q5SSZ5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tns3Q5SSZ5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms