Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms